شهادت حاج آقا مصطفی خمینی گرچه با هدف حذف ایشان صورت گرفت؛ اما جدا از این رژیم شاه اهداف دیگری را نیز دنبال می‌کرد. در واقع جدا از آنکه شخصیت حاج آقا مصطفی خمینی برای رژیم غیرقابل تحمل بود؛ اهداف دیگری نیز در بطن این ماجرا نهفته بود