آیت‌الله مهدوی کنی از جمله روحانیونی است که بعد از دستگیری مورد شکنجه ساواک قرار گرفتند. علاوه بر این، ایشان جهت اقرار به اعترافات اجباری نیز تحت شکنجه بودند؛ اما هیچ‌گاه در برابر این شکنجه‌ها تسلیم نشدند